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Ricerca scientifica e accademica
182 skill per Claude e ChatGPT
In questa pagina trovi tutte le 182 skill della categoria Ricerca scientifica e accademica, divise in 8 sottocategorie. 115 funzionano con Claude, 67 sono compatibili con ChatGPT e 182 sono gratuite. Per ogni skill trovi la fonte originale e, nella scheda, il testo pronto da copiare per installarla.
Filtra nel catalogo completoGenomica e bioinformatica
55 skill
13c-metabolic-flux
Stima i flussi metabolici intracellulari da misure stazionarie di tracciamento isotopico del carbonio-13, eseguendo simulazioni e fitting vincolati. Segnala limiti dei dati o la necessità di analisi non stazionarie.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesearboreto
Inferisce reti candidate di regolazione genica da dati di espressione bulk o single-cell con Arboreto, GRNBoost2 e GENIE3. Classifica associazioni tra fattori di trascrizione e bersagli e supporta verifiche di stabilità.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesebgee-skill
Interroga Bgee tramite SPARQL per recuperare metadati sull’espressione genica in condizioni sane e wild-type, formulando ricerche che tengono conto delle ontologie.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesebiobankjapan-phewas-skill
Recupera riepiloghi PheWAS da BioBank Japan per una variante singola identificata tramite rsID o coordinate GRCh37/GRCh38, convertendo le coordinate nel formato GRCh37 richiesto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesebiostudies-arrayexpress-skill
Prepara richieste API a BioStudies e ArrayExpress per effettuare ricerche testuali o recuperare studi tramite accession, restituendo riepiloghi concisi dei risultati.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesecbioportal-skill
Interroga cBioPortal per recuperare e sintetizzare dati relativi a studi, profili molecolari, mutazioni, informazioni cliniche e campioni.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesecellxgene-census
Interroga il CZ CELLxGENE Census per recuperare metadati, espressione genica, conteggi, embedding e riferimenti a dati single-cell e spaziali, consentendo confronti per versione, organismo, tessuto, malattia, saggio e tipo cellulare.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseclinvar-variation-skill
Cerca varianti e identificativi tramite ClinVar Clinical Tables e NCBI Variation, recuperando dati VCV, RCV, SCV e RefSNP e riepilogando le associazioni tra identificativi.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesedeeptools
Elabora dati NGS con deepTools, convertendo file BAM in bigWig e producendo controlli di qualità, correlazioni, PCA, fingerprint, heatmap e profili su regioni di interesse.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseepigraphdb-skill
Interroga EpiGraphDB per ottenere riepiloghi su ontologie, letteratura, randomizzazione mendeliana, relazioni gene-farmaco e prove di supporto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseeqtl-catalogue-skill
Interroga l’API dell’eQTL Catalogue per recuperare associazioni e metadati documentati, fornendo riepiloghi concisi dei risultati.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaIngleseeva-skill
Consulta l’European Variation Archive tramite richieste REST per recuperare metadati sulle specie e sulle varianti archiviate, restituendo riepiloghi concisi.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesefinngen-phewas-skill
Recupera riepiloghi FinnGen PheWAS per varianti identificate tramite rsID o coordinate GRCh37/GRCh38, convertendo l’input nel formato GRCh38 richiesto.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesegenebass-gene-burden-skill
Prepara richieste compatte a Genebass per un gene identificato tramite Ensembl e un insieme di burden, quindi restituisce un riepilogo conciso dei risultati PheWAS.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesegeniml
Guida l’analisi locale di intervalli genomici, verificando file BED e universi e pianificando esecuzioni di Region2Vec o scEmbed in base alla compatibilità di modelli e tokenizer.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesegget
Interroga da CLI o Python oltre 20 risorse bioinformatiche per cercare geni, sequenze, strutture, annotazioni, arricchimenti e dati di espressione, indicando alternative quando servono analisi più complesse.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseginkgo-cloud-lab
Assiste nella scelta dei protocolli e nella preparazione degli input per esperimenti di espressione proteica, sintesi di RNA e saggi presso Ginkgo Cloud Lab, guidando anche l’ordine tramite browser.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesegnomad-graphql-skill
Interroga gnomAD tramite GraphQL usando identificativi di varianti o geni e restituisce riepiloghi concisi di frequenze, vincoli genici e informazioni contestuali disponibili.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesegtars
Elabora intervalli genomici con Gtars, eseguendo operazioni tra insiemi, conteggi di sovrapposizioni, calcoli di copertura, tokenizzazione e trattamento di frammenti.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesegtex-eqtl-skill
Recupera associazioni eQTL GTEx per un singolo tessuto a partire da un rsID o da coordinate GRCh37/GRCh38, convertendo l’input nel formato GRCh38 richiesto dall’API.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesehmdb-skill
Interroga HMDB per cercare metaboliti, proteine, malattie o pathway e restituisce riepiloghi concisi delle informazioni trovate nel database.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesehuman-protein-atlas-skill
Interroga Human Protein Atlas per recuperare dati sui geni, risultati di ricerca e informazioni relative a tessuti o linee cellulari, quindi ne fornisce riepiloghi concisi.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseipd-skill
Interroga l’API pubblica IPD per recuperare metadati relativi ad alleli HLA e cellule, fornendo riepiloghi concisi e salvando i dati grezzi soltanto su richiesta.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleselamindb
Gestisce dati e modelli biologici con LaminDB, registrando artefatti, tracciando lineage, validando schemi, annotando ontologie, eseguendo ricerche e organizzando raccolte, rami e archiviazione.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleselocus-to-gene-mapper-skill
Collega loci GWAS a geni candidati classificati integrando associazioni, coordinate, Open Targets, coloc, eQTL e dati genetici; produce tabelle riproducibili e, facoltativamente, figure.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesemetabolights-skill
Interroga MetaboLights per individuare studi e recuperare metadati metabolomici a livello di studio, quindi restituisce riepiloghi concisi dei risultati trovati.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesencbi-datasets-skill
Invia richieste compatte a NCBI Datasets v2 per recuperare dati su assembly, genomi, tassonomia e metadati correlati; salva i dati grezzi soltanto se richiesto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseneuropixels-analysis
Analizza registrazioni extracellulari Neuropixels con SpikeInterface, preparando i dati, eseguendo lo spike sorting e valutando la qualità delle unità; supporta formati comuni, correzione del movimento e revisione dei risultati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesenextflow-development
Esegue pipeline nf-core per analizzare dati di sequenziamento RNA-seq, WGS/WES o ATAC-seq da file FASTQ locali o dataset pubblici. Supporta accessioni GEO/SRA e creazione di samplesheet.
Solo ClaudeAvanzatoGratuitaInglesengs-amplicon-microbiome
Avvia workflow per analizzare ampliconi microbici 16S, 18S, ITS, COI o altri marcatori, usando strumenti quali nf-core/ampliseq, QIIME2, DADA2 e Cutadapt.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-analysis-router
Instrada richieste di analisi di dati di sequenziamento, inclusi BCL, FASTQ, BAM/CRAM, matrici di conteggi e VCF, alla skill NGS appropriata e chiede le sole informazioni specifiche mancanti.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-atacseq-peaks-qc
Esegue o pianifica controlli di qualità per ATAC-seq, allineamento, arricchimento TSS, dimensione dei frammenti, blacklist, chiamata e consenso dei picchi e analisi dell’accessibilità differenziale.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-bcl-to-fastq
Verifica cartelle di sequenziamento Illumina BCL e sample sheet, pianifica il demultiplexing, controlla indici, UMI e lane, converte BCL in FASTQ e interpreta le metriche.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-bulk-rnaseq
Instrada le richieste di bulk RNA-seq verso flussi di controllo qualità da FASTQ a conteggi o di espressione differenziale, individuando strumenti e pipeline bioinformatiche pertinenti.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-bulk-rnaseq-differential-expression
Pianifica o esegue analisi di espressione differenziale su dati bulk RNA-seq, verificando matrice dei conteggi, repliche, formula sperimentale, contrasti, batch, normalizzazione e qualità dei risultati.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-dna-somatic-variants
Pianifica o esegue workflow per identificare varianti somatiche in tumori, controllando abbinamento dei campioni, contaminazione, pannelli di normali, purezza, qualità e annotazione.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-dna-umi-panel-variants
Pianifica o esegue workflow per identificare varianti in pannelli DNA con UMI e letture consensus duplex, comprese chiamate a bassa frequenza e verifiche specifiche di copertura e qualità.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-dna-variant-calling
Instrada le richieste di analisi di varianti DNA WGS, WES o panel verso flussi germinali, somatici o UMI e pianifica workflow con strumenti come GATK, DeepVariant e nf-core/sarek.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-fastq-qc
Controlla file FASTQ con FastQC e MultiQC, interpreta i risultati e può eseguire trimming con fastp o Cutadapt senza sovrascrivere le letture originali.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-runtime-env
Verifica se strumenti e pacchetti NGS pubblici sono già disponibili nell’ambiente prima di scaricare, installare o avviare una pipeline di sequenziamento.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-scrna-seq
Instrada file FASTQ di RNA-seq a singola cellula o singolo nucleo verso workflow pubblici per generare conteggi e delega il controllo qualità e le analisi successive delle matrici a una skill dedicata.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesengs-shotgun-metagenomics
Avvia workflow di metagenomica shotgun per il controllo qualità, la rimozione dell’ospite e la profilazione tassonomica e funzionale, usando strumenti come nf-core/taxprofiler, Kraken2 e HUMAnN.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaIngleseonekgpd
Interroga i dati del progetto 1000 Genomes per individuare individui e varianti in geni o regioni, verificare genotipi e valutare parentela, frequenze alleliche e provenienza dei dati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesephylogenetics
Costruisce e analizza alberi filogenetici da sequenze omologhe di DNA o proteine, eseguendo allineamento, inferenza degli alberi, valutazione dei rami e visualizzazione dei risultati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepride-skill
Interroga l’API del PRIDE Archive per individuare progetti di proteomica e recuperarne i metadati a livello di progetto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseproteomexchange-skill
Interroga ProteomeXchange PROXI per trovare dati, librerie, forme peptidiche, proteine, PSM, spettri ed esempi USI, restituendo riepiloghi concisi dei risultati.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesepydeseq2
Analizza dati bulk RNA-seq con PyDESeq2, verificando i conteggi, impostando disegni e contrasti, applicando test statistici e correzione FDR e producendo visualizzazioni dei risultati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepyopenms
Elabora dati di spettrometria di massa con pyOpenMS per rilevare feature, identificare peptidi e proteine, quantificare campioni e realizzare pipeline LC-MS/MS di proteomica e metabolomica.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepysam
Legge, interroga, filtra e scrive file genomici con pysam, inclusi SAM/BAM/CRAM, VCF/BCF e FASTA/FASTQ, supportando analisi di copertura, pileup e indicizzazione.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseqiime2-amplicon
Elabora letture amplicon 16S paired-end in QIIME 2 per ottenere ASV e assegnazioni tassonomiche, mantenendo la tracciabilità degli artefatti e controllando manifest, primer, sovrapposizioni e identificativi dei campioni.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesernacentral-skill
Interroga RNAcentral per consultare voci RNA, recuperare informazioni su singoli elementi e trovare riferimenti incrociati tra le risorse disponibili.
ChatGPT + CodexBaseGratuitaInglesescanpy
Analizza dati RNA-seq a singola cellula con Scanpy, eseguendo controllo qualità, normalizzazione, riduzione dimensionale, clustering e analisi dei marker, e preparando dati pseudobulk.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesescvelo
Analizza conteggi di RNA spliced e unspliced con scVelo per stimare traiettorie e tempi latenti, verificare modelli cinetici e valutare grafi di velocità.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesetpmi-phewas-skill
Recupera riepiloghi TPMI PheWAS per una variante, ricevendo un rsID o coordinate GRCh37 o GRCh38 e convertendo l’input nel formato GRCh38 richiesto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseukb-topmed-phewas-skill
Recupera riepiloghi PheWAS UKB-TOPMed per una variante, ricevendo un rsID o coordinate GRCh37 o GRCh38 e convertendo l’input nel formato GRCh38 richiesto.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglese
Ricerca bibliografica e letteratura
31 skill
academic-plotting
Crea figure per articoli di machine learning, generando diagrammi architetturali dal testo e grafici basati sui dati con matplotlib o seaborn; aiuta a scegliere visualizzazioni adatte ai risultati sperimentali.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesebgpt-paper-search
Cerca articoli scientifici su BGPT per argomento o DOI e recupera evidenze per singola affermazione, inclusi esperimenti, statistiche, limiti e provenienza, per supportare revisioni della letteratura e sintesi delle evidenze.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseCitation and Reference Finder
Cerca pubblicazioni scientifiche e individua citazioni e riferimenti accademici a sostegno di un’affermazione fornita dall’utente.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Inglesecitation-management
Cerca articoli scientifici, recupera e verifica metadati bibliografici e genera citazioni BibTeX formattate; aiuta a trovare pubblicazioni, convertire DOI e controllare l’accuratezza dei riferimenti.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseConsensus
Cerca nella letteratura scientifica e spiega i risultati delle ricerche; aiuta a redigere articoli supportati da fonti accademiche.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Ingleseexperimental-design
Progetta studi ed esperimenti prima della raccolta dei dati, scegliendo disegni, randomizzazione, blocchi, controlli e combinazioni di trattamenti; supporta disegni fattoriali, misure ripetute, layout di piastre e gestione degli effetti di lotto o ordine.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesegwas-catalog-skill
Interroga la REST API v2 del GWAS Catalog per cercare studi, associazioni, SNP, tratti EFO, geni, pubblicazioni, loci e metadati, quindi restituisce riepiloghi concisi dei risultati.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesehuggingface-paper-publisher
Assiste nella pubblicazione e gestione di paper di ricerca su Hugging Face Hub, aiutando a creare pagine, collegare paper a modelli e dataset, rivendicare la paternità e redigere articoli in Markdown.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesehuggingface-papers
Recupera pagine di paper su Hugging Face in formato Markdown e usa l’API per ottenere metadati strutturati, così da riassumere, spiegare o analizzare paper AI indicati tramite URL o ID arXiv.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseimaging-data-commons
Cerca e scarica dati pubblici di imaging oncologico dall’NCI Imaging Data Commons, inclusi dati radiologici e patologici; supporta interrogazioni dei metadati, visualizzazione e consultazione di licenze e citazioni.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseLiterature Review
Riassume articoli accademici e aiuta a svolgere revisioni della letteratura a partire dai materiali forniti dall’utente.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)Ingleseliterature-review
Conduce revisioni sistematiche, esplorative o narrative della letteratura usando fonti scientifiche appropriate; supporta ricerche riproducibili, selezione degli studi, verifica delle citazioni e preparazione di revisioni in Markdown o PDF.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleselitreview
Organizza una revisione della letteratura chiarendo domanda, metodo e profondità desiderata, definisce un piano di ricerca, cerca studi tramite PubMed e OpenAlex e sintetizza i risultati in una guida Word.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesencbi-entrez-skill
Interroga NCBI Entrez per cercare, recuperare e sintetizzare dati di PubMed, Gene, Protein, Nucleotide, PMC e GEO; salva dati grezzi in JSON o XML solo su richiesta.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseopentargets-skill
Interroga Open Targets Platform per riepilogare dati su target, malattie, farmaci, varianti e studi; può includere ricerche e matrici delle evidenze suddivise per fonte dati.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesepaper-lookup
Cerca articoli e preprint tramite 18 API accademiche e restituisce risultati con provenienza verificabile, inclusi citazioni, DOI, abstract, testi integrali, accesso aperto, autori e record di repository.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesepaperclip
Cerca e legge articoli biomedici, documenti regolatori, studi clinici e record proteici tramite GXL Paperclip; estrae evidenze e offre analisi di figure e citazioni puntuali con riferimenti alle righe.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesepaperzilla
Consulta progetti e feed tramite la CLI pz, recupera raccomandazioni e articoli canonici su Paperzilla e fornisce dettagli o riassunti; supporta esportazioni JSON, feedback e feed Atom.
Claude + altri agentiBaseGratuitaInglesepresenting-conference-talks
Crea presentazioni per conferenze a partire da articoli scientifici e produce slide Beamer in PDF o file PPTX modificabili, con note per chi presenta e copione del discorso.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesePubMed Buddy
Esplora la letteratura scientifica in modo conversazionale, cercando in PubMed e accedendo agli articoli disponibili tramite UnPaywall.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Inglesepycalphad
Calcola equilibri CALPHAD a temperatura finita, frazioni di fase e composizioni da database termodinamici TDB con pycalphad; supporta studi di stabilità delle leghe, sweep di temperatura e verifiche della regola della leva.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepyzotero
Gestisce librerie Zotero tramite API o API locale, cercando, creando, aggiornando ed eliminando riferimenti, raccolte, tag e allegati; esporta citazioni e carica PDF.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseresearch-lookup
Raccoglie evidenze e riferimenti bibliografici aggiornati per manoscritti e sintesi scientifiche, includendo risultati concordanti e contrastanti; prepara pacchetti di ricerca approfonditi e recupera le fonti secondo le opzioni richieste.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseResearch: Academic, Paper, Scholar, Report
Aiuta a riassumere articoli scientifici, individuare studi recenti e preparare testi accademici, citazioni, analisi dei dati e visualizzazioni; cerca anche nel catalogo Consensus.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)IngleseScholar
Supporta la ricerca e la lettura critica consultando risorse accademiche, tra cui Google Scholar, PubMed, JSTOR e arXiv.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)Inglesescientific-db-pubmed-database
Fornisce procedure per cercare su PubMed e NCBI E-utilities, usare query MeSH, trovare PMID, recuperare citazioni e monitorare la letteratura biomedica.
Solo ClaudeIntermedioGratuitaInglesescientific-thinking-literature-review
Pianifica revisioni sistematiche della letteratura definendo la ricerca, selezionando le fonti, sintetizzando i risultati e verificando citazioni ed evidenze; registra il percorso per renderlo tracciabile.
Solo ClaudeAvanzatoGratuitaInglesescientific-thinking-scholar-evaluation
Valuta articoli, proposte, revisioni e sezioni metodologiche con criteri strutturati, esamina la qualità delle evidenze e il supporto delle citazioni e offre feedback di ricerca.
Solo ClaudeAvanzatoGratuitaInglesesr-screener
Supporta lo screening di studi per revisioni sistematiche, scoping e rapide applicando criteri di eleggibilità e controllo qualità con revisori AI e adjudication; gestisce deduplicazione, conteggi PRISMA 2020 e produce registri, gruppi bibliografici e una bozza dei metodi.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesesystems-paper-writing
Fornisce strutture, modelli LaTeX, checklist e indicazioni per redigere articoli di ricerca sui sistemi informatici e prepararli per conferenze specialistiche.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseZotero
Usa Zotero Desktop per cercare in una libreria locale, gestire riferimenti e collezioni, esportare BibTeX, inserire chiavi di citazione e importare record bibliografici.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglese
Ricerca approfondita e multi-fonte
30 skill
ara-compiler
Trasforma articoli, repository, log di esperimenti, codice o appunti in artefatti di ricerca strutturati, con evidenze, concetti, configurazioni e collegamenti esplorabili dagli agenti.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseara-research-manager
Ricostruisce decisioni, esperimenti, vicoli ciechi e cambi di direzione al termine di sessioni di ricerca o programmazione, registrando nella cartella ara il percorso e la provenienza del lavoro.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesearbor
Applica il metodo Arbor per affinare ipotesi su artefatti di ricerca tramite esperimenti ripetibili e gestione delle evidenze. Confronta candidati usando dati di verifica.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseAskYourPDF Research Assistant
Analizza PDF e documenti forniti, risponde a domande sui loro contenuti e supporta la ricerca bibliografica. Genera testi, riferimenti e basi di conoscenza a partire dai materiali consultati.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Ingleseautoresearch
Coordina progetti di ricerca AI autonomi organizzando esperimenti iterativi e sintesi dei risultati per orientare le fasi successive; può produrre presentazioni e articoli e instradare il lavoro verso skill specializzate.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesebrainstorming-research-ideas
Guida i ricercatori nell’esplorazione di problemi e progetti attraverso framework strutturati di ideazione, per individuare nuove direzioni di ricerca promettenti.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesebuild-evidence-map
Costruisce mappe di evidenze verificabili per decisioni tecniche, ricerche, proposte o revisioni. Organizza prove a favore, contrarie, qualificanti e mancanti, collegandole ai passaggi esatti delle fonti senza appiattire i disaccordi.
Copilot + ClaudeAvanzatoGratuitaInglesecreative-thinking-for-research
Applica metodi di creatività basati sulle scienze cognitive per generare idee di ricerca in informatica e AI, usando analogie, combinazioni e manipolazione dei vincoli.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesedeep-research
Conduce ricerche approfondite su più fonti web, pianifica sotto-domande e sintetizza i risultati con citazioni e livelli di confidenza. Supporta anche analisi competitive, valutazioni tecnologiche e due diligence.
Solo ClaudeAvanzatoGratuitaInglesedeep-research
Conduce ricerche approfondite su domande o decisioni complesse, confronta più fonti e verifica le affermazioni. Sintetizza le evidenze con una revisione critica e organizza fonti e citazioni per riutilizzarle.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseDeeply Research
Svolge ricerche approfondite online su un argomento e sintetizza le informazioni raccolte in una risposta organizzata per l’utente.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Ingleseexa-search
Cerca contenuti scientifici e tecnici sul web con Exa ed estrae in batch il testo di pagine o PDF. Supporta la ricerca accademica con filtri per categoria di pubblicazione e ambito disciplinare.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesencbi-clinicaltables-skill
Interroga NCBI Clinical Tables per cercare geni umani e restituisce risultati sintetici, consentendo di paginare le risposte e selezionare i campi inclusi.
ChatGPT + CodexBaseGratuitaIngleseontology-term-resolution
Associa etichette scientifiche a termini e identificatori di ontologie e verifica CURIE esistenti. Supporta la preparazione e il controllo di metadati per archivi e progetti di ricerca.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseopen-notebook
Organizza in Open Notebook fonti di ricerca, inclusi documenti, pagine web, audio e video. Consente ricerca testuale e vettoriale, chat con citazioni, note e automazione tramite REST API.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseparallel-web
Usa Parallel CLI per cercare sul web, estrarre contenuti da URL, svolgere ricerche approfondite e arricchire dati strutturati. Supporta l’individuazione di entità e il monitoraggio ricorrente delle fonti.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesepulse
Raccoglie informazioni recenti su un tema da Reddit, Hacker News e web aperto, con X/Twitter come fonte opzionale. Produce un briefing con citazioni, metriche di coinvolgimento e schemi ricorrenti tra piattaforme.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepymoo
Risolve problemi di ottimizzazione a uno o più obiettivi con pymoo, gestendo vincoli, algoritmi evolutivi e approssimazioni di Pareto. Supporta benchmark per applicazioni ingegneristiche e di ricerca.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch
Instrada le richieste di ricerca verso competenze specialistiche oppure pianifica ricerche su più fonti. Sintetizza le evidenze con citazioni e rende visibile il metodo scelto.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch
Indaga una domanda consultando fonti primarie affidabili e raccoglie i risultati in un file Markdown nel repository. Approfondisce argomenti e reperisce informazioni su documentazione o API.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch-ops
Organizza ricerche su informazioni aggiornate, confronti e raccomandazioni, usando fonti pubbliche attuali e il contesto locale fornito. Presenta evidenze verificabili a supporto dei risultati.
Solo ClaudeIntermedioGratuitaIngleseresearch-ops-skills
Instrada attività di ricerca aziendale verso competenze specialistiche per studi clinici, finanza R&D, ricerche di mercato e ricerca prodotto. Aiuta a pianificare, dimensionare e sintetizzare i progetti di ricerca.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch-router-skill
Indirizza domande ampie di ricerca nelle scienze della vita verso fonti e analisi pertinenti, normalizza le entità e sintetizza le evidenze raccolte.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaIngleseResearch|R&D|Academic|Paper Writer|Scholar|Report
Raccoglie e sintetizza informazioni per attività di ricerca e R&D, propone spunti e redige articoli o report. Produce report scaricabili in PDF a partire dal tema indicato.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)Inglesescientific-brainstorming
Guida sessioni di ideazione scientifica generando idee indipendenti e strutturando la discussione. Esplicita le assunzioni, favorisce la valutazione critica e registra le decisioni del gruppo.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesescientific-problem-selection
Aiuta gli scienziati a scegliere problemi di ricerca, sviluppare idee e superare blocchi progettuali. Supporta la valutazione dei rischi e la definizione di strategie scientifiche.
Solo ClaudeIntermedioGratuitaInglesescientific-problem-selection
Aiuta i ricercatori a scegliere problemi e progetti scientifici, sviluppare idee e affrontare progetti bloccati. Supporta la valutazione dei rischi, la definizione della strategia e le decisioni di ricerca.
Solo ClaudeIntermedioGratuitaIngleseWeb Browser
Cerca informazioni sul web a partire da una domanda e restituisce risultati utili per formulare una risposta basata sulle pagine consultate.
ChatGPTBaseGratuita (account ChatGPT)IngleseWebPilot
Naviga i contenuti online indicati e ne produce sintesi, offrendo un supporto per consultare pagine web e ricavarne le informazioni pertinenti.
ChatGPTBaseGratuita (account ChatGPT)Inglesewiki-query
Cerca nella wiki leggendo l’indice e le pagine pertinenti, quindi sintetizza una risposta con citazioni ai collegamenti interni. Può proporre di salvare la sintesi nella wiki.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglese
Analisi dati scientifici e statistica
20 skill
adaptyv
Utilizza l’API e l’SDK Python di Adaptyv Bio Foundry per progettare esperimenti di caratterizzazione proteica, stimarne i costi, inviare sequenze, monitorare le attività di laboratorio e recuperare i risultati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseastropy
Supporta l’implementazione e la correzione di analisi astronomiche in Python con Astropy, elaborando unità, coordinate, file FITS, tabelle, sistemi temporali e dati WCS o di cosmologia.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesebids
Organizza, interroga, valida e converte dataset neurobiologici secondo lo standard BIDS. Gestisce dati di imaging e altri dati biomedici, metadati e derivati.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesechebi-skill
Invia richieste all’API ChEBI 2.0 per cercare composti, consultarne i dati, esplorare l’ontologia e recuperare metadati strutturali. Restituisce informazioni sui composti e sulle loro relazioni.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesecobrapy
Esegue modellazione metabolica vincolata con COBRApy su modelli e dati biologici. Applica FBA, analisi dei flussi, knockout genici, campionamento e ottimizzazione della produzione, e valida modelli SBML.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesedatalad
Recupera, versiona e pubblica dataset scientifici con DataLad e git-annex, registrando la provenienza computazionale. Gestisce file e supporta la riproduzione documentata delle analisi.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseflowio
Legge, ispeziona e scrive file FCS 2.0, 3.0 e 3.1 con FlowIO. Estrae eventi e metadati, gestisce file multidataset ed esporta i dati in tabelle.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesegeomaster
Supporta workflow geospaziali con dati vettoriali e raster, immagini satellitari e serie temporali. Elabora dati di telerilevamento, statistiche spaziali e del terreno, allineando coordinate e griglie e consultando cataloghi STAC.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesehugging-science
Cerca e valuta nel catalogo Hugging Science dataset, modelli, metodi e applicazioni scientifiche. Verifica le risorse disponibili e le modalità d’uso per diversi ambiti di ricerca.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesemageck
Analizza screening CRISPR con MAGeCK a partire da letture FASTQ o matrici di conteggio. Verifica librerie, confronti e qualità, quindi produce classifiche di geni con dimensioni dell’effetto e FDR.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesencbi-blast-skill
Invia e monitora richieste alla API NCBI BLAST per sequenze nucleotidiche o proteiche, quindi sintetizza i risultati principali. Recupera dati grezzi in formato Text o JSON2 solo su richiesta.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesengs-chip-cutrun-peaks-qc
Pianifica o esegue workflow ChIP-seq, CUT&RUN o CUT&Tag considerando controlli, spike-in, chiamata dei picchi e repliche. Supporta la produzione di bigWig e l’analisi differenziale del legame.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesenwb-conversion
Converte dati di acquisizione neuroscientifica nel formato Neurodata Without Borders con NeuroConv e PyNWB. Preserva metadati e riferimenti temporali, controlla lo schema e supporta ispezione e conversione inversa per i formati disponibili.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseprimekg
Interroga una versione fissata del grafo PrimeKG per trovare nodi e associazioni tra geni, farmaci, malattie e fenotipi. Ricostruisce percorsi di uno o due passaggi e ne riporta la provenienza dei dati.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesepytdc
Accede ai dataset e ai benchmark di Therapeutics Data Commons tramite PyTDC. Supporta la selezione dei dati, delle suddivisioni per compito e delle procedure per valutare modelli terapeutici.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesescientific-critical-thinking
Valuta affermazioni e prove scientifiche esaminando disegno sperimentale, bias, confondenti e interpretazione statistica. Applica strumenti per valutare la qualità dell’evidenza e chiarire i limiti delle conclusioni.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesescrna-seq-qc
Elabora e controlla dati RNA-seq a singola cellula o singolo nucleo, filtrando doppietti e RNA ambientale. Annota le cellule e genera visualizzazioni UMAP globali e per gruppo.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesestatistical-analysis
Guida l’analisi statistica di dati di ricerca, dalla scelta dei test alla verifica delle assunzioni e al calcolo delle dimensioni degli effetti. Supporta metodi classici, non parametrici e bayesiani e la redazione dei risultati in formato APA.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesestatistical-power
Calcola dimensioni campionarie, potenza statistica, effetti minimi rilevabili e curve di potenza per pianificare studi. Applica metodi analitici e simulazioni Monte Carlo anche a disegni complessi.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesewhat-if-oracle
Esamina scenari favorevoli, avversi e alternativi per mettere alla prova piani di ricerca e decisioni progettuali. Esplicita ipotesi, evidenze e possibili segnali decisionali, senza stimare effetti causali o probabilità previsionali calibrate.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglese
Chimica e modellazione molecolare
20 skill
boltz-structure-and-binding
Predice la struttura di un singolo complesso di proteine, RNA, DNA o ligandi, includendo docking, interfacce e affinità di legame. Non è destinata allo screening di librerie o alla progettazione.
ChatGPT + CodexAvanzatoGratuitaInglesecantera
Simula reattori chimici omogenei a partire da meccanismi e condizioni operative, calcolando ritardi di accensione e storie di temperatura. Confronta i meccanismi e verifica conservazione e stabilità numerica.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesecirq
Progetta circuiti quantistici in Cirq e modella gli effetti del rumore. Supporta esperimenti di caratterizzazione, in particolare per hardware Google Quantum AI.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesedatamol
Elabora molecole descritte in SMILES con Datamol e RDKit, standardizzandole e calcolando descrittori e impronte. Raggruppa i composti e genera conformeri 3D per workflow di scoperta di farmaci.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesediffdock
Genera pose di legame tra proteine e piccole molecole da strutture o sequenze e file di molecole. Supporta docking in batch, selezione delle pose e interpretazione della confidenza, senza predire l’affinità di legame.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesefluidsim
Configura e controlla simulazioni di fluidodinamica computazionale con FluidSim, aiutando a scegliere il solver e verificare parametri e output. Gestisce riavvii e controlla validità numerica e sicurezza HPC.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesemarine-carbonate-chemistry
Calcola la chimica dei carbonati nell’acqua marina con PyCO2SYS, inclusi speciazione e saturazione di aragonite e calcite. Applica correzioni di temperatura e pressione e propaga l’incertezza.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesematchms
Elabora, pulisce e confronta spettri tandem MS/MS con matchms. Supporta ricerche in librerie, calcolo di similarità e matrici di punteggio e creazione di reti di somiglianza molecolare.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesematlab
Crea, revisiona e migra workflow numerici in MATLAB o GNU Octave, gestendo array e dati tabellari o temporali. Supporta test, grafici e interoperabilità con Python.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesemedchem
Filtra e classifica composti per attività di chimica medicinale applicando regole di drug-likeness, avvisi strutturali e metriche di complessità. Supporta anche il linguaggio di query medchem.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesemolecular-dynamics
Imposta ed esegue simulazioni di dinamica molecolare con OpenMM e analizza le traiettorie con MDAnalysis. Supporta preparazione dei sistemi, minimizzazione energetica e analisi di proprietà strutturali e di legame.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesemolfeat
Genera descrittori e rappresentazioni di piccole molecole con Molfeat per QSAR/QSPR, similarità chimica, screening virtuale e machine learning. Mantiene configurazioni e allineamento tra molecole ed etichette.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseopenpiv
Estrae campi di velocità da coppie di immagini PIV con OpenPIV, applicando correlazione e correzione di vettori anomali. Calcola inoltre vorticità, deformazione e statistiche di turbolenza.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepubchem-pug-skill
Interroga PubChem PUG REST per ottenere proprietà e descrizioni di composti, riepiloghi di saggi e metadati sulle sostanze. Restituisce i dati disponibili per le richieste effettuate.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesepymatgen
Analizza, verifica, converte e trasforma strutture di materiali e dati computazionali con pymatgen. Supporta diagrammi di fase, simmetria, dati di struttura elettronica e interrogazioni circoscritte a Materials Project.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseqiskit
Crea, simula e transpila circuiti quantistici con Qiskit, usando primitive e simulazioni locali o rumorose. Supporta l’esecuzione su dispositivi IBM Quantum e la mitigazione degli errori.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesequtip
Simula e verifica sistemi quantistici chiusi e aperti con QuTiP, calcolandone dinamiche, stati stazionari e spettri. Supporta inoltre l’analisi della convergenza numerica.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleserhea-skill
Cerca in Rhea reazioni biochimiche e relativi identificativi. Restituisce riepiloghi concisi dei risultati trovati.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesesimpy
Crea, testa e analizza simulazioni a eventi discreti basate su processi con SimPy. Gestisce code, risorse e interruzioni, esegue repliche e supporta analisi riproducibili dei risultati.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesesympy
Esegue calcoli matematici simbolici esatti con SymPy, tra cui algebra, calcolo, risoluzione di equazioni e algebra lineare. Genera anche codice o formule LaTeX.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglese
Scrittura e revisione accademica
15 skill
Academic GPT
Analizza quesiti di ricerca accademica e aiuta a elaborare risposte precise e rigorose, fornendo supporto nell’interpretazione e nella formulazione dei contenuti scientifici.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)IngleseAcademic Researcher
Supporta la ricerca accademica e la stesura di articoli, aiutando a sviluppare contenuti e a organizzare il lavoro di scrittura scientifica.
ChatGPTAvanzatoGratuita (account ChatGPT)Ingleseara-rigor-reviewer
Esamina artefatti di ricerca ARA secondo sei dimensioni, inclusi qualità delle evidenze e rigore metodologico, e produce una valutazione motivata con criticità ordinate per gravità e raccomandazione finale.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesebiorxiv-skill
Interroga le API di bioRxiv e medRxiv per recuperare metadati dei preprint biomedici, collegamenti alle pubblicazioni e informazioni sui DOI, restituendo i dati richiesti.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaInglesegeopandas
Fornisce indicazioni e strumenti di audit per workflow Python che usano GeoPandas, coprendo GeoSeries e GeoDataFrame, operazioni spaziali e lettura o scrittura di dati vettoriali.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesehypothesis-generation
Trasforma osservazioni o risultati preliminari in domande scientifiche, ipotesi alternative, previsioni verificabili, misurazioni e piani di analisi predisponibili alla preregistrazione.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseml-paper-writing
Supporta la scrittura di articoli scientifici di machine learning per conferenze come NeurIPS, ICML e ACL, aiutando a strutturare gli argomenti, verificare le citazioni e preparare la versione finale.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseopentrons-integration
Crea, revisiona, migra, simula e risolve problemi nei protocolli Python per robot Opentrons Flex e OT-2, configurando pipette, labware, moduli e gestione dei liquidi.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepeer-review
Prepara bozze di peer review costruttive e valutazioni strutturate basate sulle evidenze per manoscritti, protocolli, preprint e proposte di ricerca; esamina metodi, statistiche, riproducibilità, etica, figure e coerenza tra affermazioni e prove.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch-summarizer
Riassume articoli scientifici, pagine web, report e documentazione, estraendo risultati chiave e confrontando le fonti; produce sintesi strutturate e citazioni formattate.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseResearchGPT
Cerca articoli accademici tramite Consensus e fornisce risposte basate su evidenze scientifiche con citazioni accurate; aiuta anche a redigere contenuti di ricerca.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)IngleseScholar GPT
Consulta Google Scholar per trovare informazioni e studi pertinenti alla ricerca accademica, aiutando a individuare fonti utili per approfondire un argomento.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Inglesescholar-evaluation
Valuta qualitativamente e in modo tracciabile lavori accademici e controlla rubriche per la valutazione della ricerca a basso impatto; non classifica persone né supporta decisioni con conseguenze rilevanti.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesescientific-slides
Progetta presentazioni per conferenze, seminari, discussioni di tesi e altri interventi di ricerca, fornendo struttura, modelli grafici, indicazioni sui tempi e verifica visiva per PowerPoint o LaTeX Beamer.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglesevenue-templates
Prepara manoscritti, articoli, poster e proposte secondo le regole di una sede editoriale o conferenza, aiutando a scegliere template, controllare requisiti di pagina e anonimato, adattare la scrittura e verificare i PDF.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaInglese
Altri temi
9 skill
analytical-method-validation
Pianifica e documenta la convalida, la verifica e il trasferimento di metodi analitici secondo standard e linee guida applicabili, definendo criteri di accettazione e prestazioni richieste.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseefo-ontology-skill
Invia richieste sintetiche a EFO OLS4 per cercare termini, recuperarne i dettagli e consultare termini figli o discendenti, restituendo riepiloghi concisi sull’ontologia EFO.
ChatGPT + CodexIntermedioGratuitaIngleseinterview-script
Prepara tracce strutturate per interviste ai clienti con domande di apertura, approfondimento e chiusura basate su comportamenti passati, evitando domande suggestive e presentazioni promozionali del prodotto.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleselatex-posters
Crea poster scientifici in LaTeX con beamerposter, tikzposter o baposter, organizzando layout a colonne, figure e tipografia, e supporta compilazione e verifica dei PDF prodotti.
Claude + altri agentiIntermedioGratuitaIngleseMacro Economics Expert
Spiega temi di macroeconomia e fornisce risposte alle domande dell’utente, chiarendo concetti e argomenti della disciplina.
ChatGPTIntermedioGratuita (account ChatGPT)Inglesenmrglue
Elabora segnali FID NMR monodimensionali con nmrglue, applicando trasformata di Fourier, correzione della linea di base e integrazione per generare spettri corretti in fase e candidati picchi riproducibili.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglesepybamm
Simula con PyBaMM cicli di carica, scarica e riposo delle batterie agli ioni di litio, verifica la sensibilità numerica e confronta le curve previste con le misurazioni disponibili.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleserelion
Verifica ed esegue workflow RELION per il refinement cryo-EM a particella singola, controllando metadati, stack di particelle, half-set, maschere e diagnostica FSC.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleserelsa-severity-assessment
Combina misure di benessere animale in punteggi RELSA e stima in modo esplorativo il rischio che un endpoint umanitario venga raggiunto a una futura osservazione.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglese
Finanziamenti e progetti di ricerca
2 skill
grants
Aiuta i ricercatori clinici a definire una strategia per una candidatura NIH, individuando istituti, programmi e bandi pertinenti. Produce un documento Word con raccomandazioni, tempistiche e indicazioni su budget e ambito.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaIngleseresearch-grants
Supporta la preparazione e la revisione di proposte di finanziamento per NSF, NIH, DOE, DARPA e Taiwan NSTC. Aiuta a controllare requisiti, obiettivi, criteri di valutazione, budget, moduli e documenti di revisione.
Claude + altri agentiAvanzatoGratuitaInglese
Dati aggiornati al 14 ottobre 2026. MondoSkills è un archivio di skill pubblicate da altri: leggi le avvertenze.